نجاشی و شیخ طوسی در فهرست خود از هزاران اثر نگاشته شده در طول پنج قرن نخست نام برده‌اند. کند و کاو در این دو فهرست نشان می‌دهد که عالمان شیعه در موضوعات متنوعی از اصول عقاید، احکام و اخلاق گرفته تا ادبیات و طب و سایر علوم آثاری را تحریر کرده‌اند. استخراج و دسته بندی موضوعی تألیفات در فهرست نجاشی و شیخ طوسی گواه آن است که عمده‌ترین حوزه‌های میراث مکتوب شیعه در پنج قرن نخست در هشت موضوع کلی می‌گنجد:
۱- علوم قرآن
۲- تفسیر
۳- ادعیه و زیارات
۴- اخلاق
۵- تاریخ
۶- کلام
۷- فقه
۸- رجال